徐州市疾控中心完成納米孔三代測(cè)序系統(tǒng)安裝及技術(shù)培訓(xùn)工作

  全程導(dǎo)醫(yī)網(wǎng) 徐州健康信息:隨著生物科技的不斷發(fā)展,基因測(cè)序技術(shù)逐漸成為生物學(xué)研究的重要技術(shù)手段之一。與前兩代測(cè)序相比,三代測(cè)序最大的特點(diǎn)就是單分子測(cè)序,測(cè)序過(guò)程無(wú)需進(jìn)行PCR擴(kuò)增,實(shí)現(xiàn)了對(duì)每一條DNA分子的單獨(dú)測(cè)序,近年來(lái)受到廣泛關(guān)注。為了滿(mǎn)足日常檢測(cè)工作中對(duì)三代測(cè)序技術(shù)應(yīng)用的需求,提升檢驗(yàn)人員對(duì)病原微生物分子的檢測(cè)分析能力,徐州市疾控中心微生物檢驗(yàn)科于11月8-9日完成三代測(cè)序儀Nanopore GridION的安裝工作及三代測(cè)序理論和實(shí)操培訓(xùn)。

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  此三代測(cè)序系統(tǒng)為英國(guó)牛津納米孔公司所開(kāi)發(fā),具有超長(zhǎng)讀長(zhǎng)、實(shí)時(shí)測(cè)序、靈活快速、擴(kuò)展性高、測(cè)序耗時(shí)短等特點(diǎn),已應(yīng)用于基因組測(cè)序、甲基化研究和突變鑒定等多個(gè)研究領(lǐng)域。微生物檢驗(yàn)科工作人員在工程師指導(dǎo)下,經(jīng)過(guò)核酸提取、全基因組捕獲及文庫(kù)構(gòu)建、基因測(cè)序儀運(yùn)算分析和下機(jī)序列分析比對(duì)等步驟,成功完成對(duì)新型冠狀病毒和沙門(mén)氏菌的全基因組的測(cè)定及分析比對(duì),獲得全基因組序列覆蓋度分別高達(dá)99.97%和99.67%。

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  通過(guò)此次培訓(xùn),微生物檢驗(yàn)科工作人員掌握了三代測(cè)序的基礎(chǔ)理論,具備了獨(dú)立操作的能力。為日后運(yùn)用三代測(cè)序技術(shù)開(kāi)展突發(fā)傳染病疫情檢測(cè)提供了強(qiáng)有力的保障,也標(biāo)志著市疾控中心微生物檢測(cè)技術(shù)繼二代測(cè)序后邁上新臺(tái)階,實(shí)現(xiàn)分子生物學(xué)應(yīng)用、研究里程碑式的跨越,也表明我市疾病預(yù)防控制中心在傳染病病原體溯源能力方面又有新的突破。(徐州疾控 撰稿:高雪)

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