用基因組分析技術找到肝癌轉(zhuǎn)移關鍵突變基因

　　全程導醫(yī)網(wǎng) 健康焦點：上海交通大學醫(yī)學院附屬瑞金醫(yī)院和國家人類基因組南方研究中心腫瘤基因組課題組韓澤廣教授、鄧慶博士與黃健研究員領銜的科研團隊，最近首次利用新型大規(guī)模基因組分析技術，找到肝癌轉(zhuǎn)移關鍵突變基因。相關研究論文于8月26日在線發(fā)表在國際頂尖學術刊物《自然·遺傳學》雜志上。專家認為，該研究結果將為肝癌診斷、預后、治療以及開發(fā)新型治療藥物奠定基礎。

　　韓澤廣等科研人員與上海生物芯片國家工程研究中心、復旦大學附屬中山醫(yī)院、無錫市人民醫(yī)院等單位合作，利用DNA測序技術，對乙肝病毒感染相關的肝癌原發(fā)灶和侵犯肝臟門靜脈轉(zhuǎn)移灶的全部基因組外顯子進行比對分析，發(fā)現(xiàn)腫瘤細胞存在347個突變基因，平均每個腫瘤樣本有30個~40個基因突變，其中大多數(shù)基因突變是第一次在肝癌樣本中發(fā)現(xiàn)，并且在原發(fā)灶和轉(zhuǎn)移灶中同時出現(xiàn)，說明肝癌發(fā)病、轉(zhuǎn)移與基因突變密切相關，而轉(zhuǎn)移相關基因在原發(fā)腫瘤中即發(fā)生突變，而不是在腫瘤轉(zhuǎn)移過程中發(fā)生。另外，從堿基突變規(guī)律發(fā)現(xiàn)，突變除受黃曲霉素和內(nèi)源代謝產(chǎn)物影響外，也可能與植物特定成分(如馬兜鈴酸)和塑料工業(yè)污染物有關。

　　為了確定哪個突變基因在肝癌轉(zhuǎn)移中發(fā)揮關鍵作用，科研人員進一步在大量肝癌樣本中，對這些突變基因進行評估以及大規(guī)模的功能實驗分析研究。結果表明，大多數(shù)基因突變不是關鍵的，僅少數(shù)基因突變決定了腫瘤發(fā)病和轉(zhuǎn)移，其中ARID1A、VCAM1和CDK14等基因突變發(fā)揮關鍵作用。ARID1A和VCAM1基因在功能正常時，起抑制腫瘤細胞作用，當突變發(fā)生導致基因功能喪失或者表達降低時，腫瘤細胞會出現(xiàn)增殖加快、運動和侵襲能力增強。目前，科研人員已經(jīng)發(fā)現(xiàn)，13%的肝癌患者發(fā)生ARID1A基因突變;VCAM1除了突變外，還在多數(shù)肝癌樣本中表達下降。而與細胞增殖相關的CDK14基因突變則會增強該基因功能，導致細胞生長加快，促進轉(zhuǎn)移，可能是肝癌治療新靶標。