徐州市疾控中心完成納米孔三代測序系統(tǒng)安裝及技術(shù)培訓(xùn)工作

  全程導(dǎo)醫(yī)網(wǎng) 徐州健康信息:隨著生物科技的不斷發(fā)展,基因測序技術(shù)逐漸成為生物學(xué)研究的重要技術(shù)手段之一。與前兩代測序相比,三代測序最大的特點(diǎn)就是單分子測序,測序過程無需進(jìn)行PCR擴(kuò)增,實(shí)現(xiàn)了對每一條DNA分子的單獨(dú)測序,近年來受到廣泛關(guān)注。為了滿足日常檢測工作中對三代測序技術(shù)應(yīng)用的需求,提升檢驗(yàn)人員對病原微生物分子的檢測分析能力,徐州市疾控中心微生物檢驗(yàn)科于11月8-9日完成三代測序儀Nanopore GridION的安裝工作及三代測序理論和實(shí)操培訓(xùn)。

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  此三代測序系統(tǒng)為英國牛津納米孔公司所開發(fā),具有超長讀長、實(shí)時測序、靈活快速、擴(kuò)展性高、測序耗時短等特點(diǎn),已應(yīng)用于基因組測序、甲基化研究和突變鑒定等多個研究領(lǐng)域。微生物檢驗(yàn)科工作人員在工程師指導(dǎo)下,經(jīng)過核酸提取、全基因組捕獲及文庫構(gòu)建、基因測序儀運(yùn)算分析和下機(jī)序列分析比對等步驟,成功完成對新型冠狀病毒和沙門氏菌的全基因組的測定及分析比對,獲得全基因組序列覆蓋度分別高達(dá)99.97%和99.67%。

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  通過此次培訓(xùn),微生物檢驗(yàn)科工作人員掌握了三代測序的基礎(chǔ)理論,具備了獨(dú)立操作的能力。為日后運(yùn)用三代測序技術(shù)開展突發(fā)傳染病疫情檢測提供了強(qiáng)有力的保障,也標(biāo)志著市疾控中心微生物檢測技術(shù)繼二代測序后邁上新臺階,實(shí)現(xiàn)分子生物學(xué)應(yīng)用、研究里程碑式的跨越,也表明我市疾病預(yù)防控制中心在傳染病病原體溯源能力方面又有新的突破。(徐州疾控 撰稿:高雪)

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